Další podstatnou nevýhodou zvláště pro CAM systémy je, že existuje málo možností, jak jednou vyexportovaný STL soubor editovat. CAM systém proto musí spoléhat na to, že CAD vyprodukuje bezvadnou STL reprezentaci s vhodnou tolerancí. To však závisí nejen na schopnostech CAD systému, ale i na jeho operátorovi.
Jisté způsoby, jak opravit vadné STL soubory, však existují. Například software firmy Delcam má funkci nazvanou TriFIX. Ta setřídí spojitosti plošek a vyplní malé mezery, odstraní duplicitní uzly, napraví překrývající se trojúhelníky atd. Navíc do CAM procesoru může být zabudována inteligence, která je shovívavá k nedokonalým modelům. Například když systém PowerMILL vytváří dráhu nástroje, automaticky přechází přes díry v geometrii menší, než je průměr vybraného nástroje. Avšak žádný záchranný kit nemůže kompenzovat příliš volně nastavenou toleranci plošek nebo dokonce opravovat model bez úkosů, s nevhodně zvolenou dělicí rovinou nebo bez jiných důležitých tvarů. Tyto případy vyžadují návrat k původnímu plošnému nebo objemovému modelu a jeho editaci.
Při převodu ploch do ploškového modelu jsou ztraceny hranice ploch. Často mohou být tyto hranice znovu vytvořeny funkcemi CAM, ovšem bohužel ne vždy. Funkce jako tužkové dokončování (nástroj je automaticky veden po ostrých průsečnicích ploch), jsou sice stále možné, ale jen s použitím algoritmů analyzujících ploškové modely a hledající náhlé změny v povrchových normálách.