Unikátní mikroskop Magellan představuje nejnovější typ elektronového mikroskopu dosahujícího rozlišení menšího než 1 nanometr, a to v celém energetickém rozsahu elektronů. Špičkové zařízení, jediné v ČR a jedno z mála na světě, vyrobila americká firma FEI. Společnost FEI je světovým lídrem v této oblasti měřicí techniky, která má jedno své vývojové a výrobní centrum také v Brně. Nový mikroskop, s dříve nedosažitelnou kvalitou funkčních parametrů, je připraven pro vývoj nových mikroskopických metod a využití při experimentálním výzkumu.
Výzkum se má soustřeďovat nejen na materiály kovové, polymerní, polovodiče, ale i oblasti biologie atd. Zobrazení pomalými elektrony v novém mikroskopu je také velmi účinným nástrojem vývoje ultrajemnozrnných kovů s vynikajícími mechanickými vlastnostmi. Konkrétním příkladem využití nového přístroje je sledování mikroskopických degradací stěn atomových reaktorů s cílem zachytit vznik trhlin v materiálu. Mikroskop se třemi analytickými přístavky a doplňky umožní analýzu rentgenového záření, zobrazení difrakce elektronů, analýzu katodoluminiscence (pro studium minerálů a jiných nevodivých materiálů) a režim pomalých elektronů.