Dalším úskalím je kapitola 5.4., kde bude muset žadatel porovnat své nově instalované zařízení s nejlepšími dostupnými technikami, tzv. BAT . Domníváme se, že toto je jeden z nejzávažnějších a nejtěžších bodů v žádosti, neboť se opakuje ještě v kapitole 7.1.5, 7.4.6, 8.9 a 10.12. Pro posouzení nejlepších dostupných technik jsou k dispozici tzv. BREF dokumenty.
Tyto základní dokumenty popisující evropský standard, tzv. referenční dokumenty BREF, vznikají v procesu výměny informací o BAT. BREF nestanoví žádné povinné techniky, technologie nebo hodnoty emisních limitů, ale potřebné informace k posouzení aplikovatelnosti určité techniky jak obecně, tak v konkrétních případech. Záměrem BREF je poskytnout informace pro stanovení podmínek provozu, včetně informací o dosažitelných hodnotách emisních limitů, ale také o výši spotřeby surovin, energií a materiálů, které mohou být dosaženy. Informace uvedené v tomto dokumentu mají být použity jako vstupní ukazatele při určování BAT ve specifických případech.
Kvalitně a komplexně zpracované porovnání nejlepších dostupných technik daného nového zařízení podle BREF je velmi dlouhý, pracný a pečlivý úkol, neboť pro povrchové úpravy je nutné použít několik "brefů", které s tímto problémem souvisejí. Konkrétně je nutné použít BREF pro povrchové úpravy s použitím rozpouštědel, BREF pro povrchové úpravy kovů, BREF pro nakládání s odpadními vodami a odpadními plyny, BREF pro výrobu a zpracování neželezných kovů, BREF pro zpracování železných kovů, BREF o obecných principech monitorování a BREF pro emise ze skladování. Tyto dokumenty jsou samozřejmě k dispozici na //www.ippc.cz, ale jejich aplikace na dané zařízení není jednoduchá. Ten, kdo tyto dokumenty vidí prvně, bude mít problém naučit se s nimi zacházet a vybrat z nich pro svou technologii to důležité a podstatné.